罪恶升级谋杀的开始
972年1月2日，盖西在芝加哥灰狗巴士总站搭讪一位15岁的名为蒂莫西·麦科伊（Timothy Jack McCoy）的年轻人。盖西带着这位从密歇根到奥马哈旅游的男孩在芝加哥观光。盖西当晚把麦科伊带回了家，并承诺这个男孩第二天会及时送他去车站赶公共汽车。第二天早上盖西醒来的时候发现麦科伊站在他的床边，手里拿着一把菜刀。盖西从床上跳了起来，而麦科伊不小心割伤了盖西的前臂并留下疤痕。盖西从麦科伊手中抢过了菜刀，数次将其头部撞击卧室的墙壁。最后盖西一脚踢飞麦科伊。麦科伊回击，盖西抓住他并数次用菜刀刺向他，直到麦科伊死亡。盖西说后来他走到厨房时才发现麦科伊做好了早餐，无意中带着菜刀去他卧室中喊他起床。盖西将麦科伊的尸体埋在地板下，并在上面加固了一层水泥。
在1980年代对他的一次采访中，盖西说在杀害麦科伊后，他感到“精疲力尽”，但同时也说在杀害麦科伊时，他感到自己到达了高潮。他说：“那时候我才意识到原来死亡能带给我最大的快感”。
盖西的第二次杀人案发生在1974年1月。受害者是一位身份不明的青少年，皮肤略带棕色，头发卷曲，大概在15到17岁之间。他是被盖西勒死的。在尸体被埋葬之前，盖西将其安置在壁橱里。盖西后来称尸体在被藏匿于壁橱时，口鼻中流出的液体弄污了他的地毯。所以在以后的犯案中，他一般都会用布条或者受害者的内衣裤塞入他们的口中以避免同样的事情发生。这位未知的受害者被埋葬在离盖西的后院中的烧烤架大概15英尺的地方。
1975年，盖西的事业得到了极大的发展。他开始每天工作12个甚至是16个小时来完成他签订的合同。他的雇员中大部分都是中学生或者是年轻的男性。其中一位是15岁大的东尼·安东努奇（Tony Antonucci）。他于1975年5月成为盖西的雇员。在当年七月，盖西来到这个男孩的家里。安东努奇前一天因为工作弄伤了脚，独自在家休养。盖西灌了他很多酒，然后将其击倒在地，并把男孩的双手铐在其身后。安东努奇右手腕的手铐有些松弛，在盖西离开房间之后男孩取下右手手铐。当盖西回来的时候，安东努奇一拳击在他脸上，将其摔倒在地，并用手铐铐住他。盖西大声咒骂男孩并口出威胁，但随即冷静下来，承诺安东努奇打开手铐的话他会立即离开安东努奇的房子。男孩同意了，盖西也随即离开了。
这次事件发生一周后，也就是1975年7月29日，盖西的另一位雇员，17岁的约翰·布特科维奇（John Butkovich）离奇失踪。在他失踪的前一天，因为盖西拖欠了两周的工资，布特科维奇对盖西进行了威胁。事后盖西承认用解决工资为由诱使布特科维奇到他家并勒死了他。当时盖西的妻子和继女都不在家，他们去阿肯色州去看望他的姐姐。盖西将死尸藏在车库的水泥地下。
布特科维奇的轿车之后被遗弃在一个停车场中。布特科维奇的父亲打电话给盖西，后者说他很乐意帮忙但很遗憾布特科维奇竟然“离家出走”。对于布特科维奇的失踪，警方也传讯过盖西，盖西说布特科维奇和他的两个朋友曾经因为工资问题去过他家，但他们在解决工资问题后已经离开了。此后，布特科维奇的父母给警方打了不下100次电话，希望警方继续深入调查盖西。
8个月后，盖西和第二任妻子离婚。因为现在独自拥有房子，他开始大开杀戒。从1976年5月到8月，盖西至少杀害了八名年轻男性，其中有两位现在还无法识别身份。七名被埋在地板下。其中的四名埋在洗衣间下（洗衣间下还埋葬了盖西之后杀害的一位青少年）。一位埋葬在盖西的饭厅地板下。在这期间被杀害的八名青年人中的六位身份已经得到辨明，年龄都在14岁到18岁之间。而另两位身份无法辨明的青少年，年龄分别在15到19岁和22到30岁之间。
1976年7月26日，盖西雇佣了18岁的大卫·克拉姆（David Cram）。同年8月21日，克拉姆搬去与盖西同住。第二天，当克拉姆酒醉后，盖西骗克拉姆戴上了手铐，然后告知克拉姆他要强奸他。克拉姆曾在军队里呆了一年，一脚将盖西踢倒在地。一个月后，盖西出现在克拉姆的卧室中，仍然想强暴克拉姆。盖西说：“大卫，你不知道我是谁。你最好给我我想要的。”克拉姆拒绝了盖西，盖西离开了他的卧室。之后克拉姆搬出了盖西的家，同时也辞去了PDM公司的工作。
1978年12月11日，盖西来到一家位于德斯普兰斯（Des Plaines）药店与店主菲尔·托夫（Phil Torf）商讨事宜。在与店老板商讨一项潜在的交易时，一名15岁的雇员罗伯特·杰尔姆·皮斯特（Robert Jerome Piest）偶然听到了他们的对话并得知盖西的公司雇佣青少年。
在盖西离开后，皮斯特告诉其母亲“有个承包商想和我讨论一份工作”。皮斯特离家，并说自己很快会回来。然而之后他却失踪
了。皮斯特的父母向当地警局申报了他们儿子的失踪案。药店主人提及盖西就是这名承包商，而皮斯特极有可能就是和他商讨工作的事情。
当警方调查盖西时，盖西否认和皮斯特谈过话，同时他谎称因为他的叔叔过世，他不得不晚些时候才能去警局去证明他的清白。第二天凌晨三时半时，盖西全身是泥巴来到了警局，声称他遇上了车祸。那天，他否认他和皮斯特的失踪案有关，也否认将提供给他一份工作。
但是德斯普兰斯警方却深信盖西和皮斯特的失踪案有关，因而对其记录进行了调查，发现其在芝加哥有过案底，并在爱荷华州因为强奸青少年曾被判决入狱。在申请了搜查令之后，警方对其房屋进行了搜查并发现了一些嫌疑物品：一个刻有“www.youxs.org.”的1975年高中毕业纪念戒、不同的驾驶执照、手铐、一块有末端有洞的木板、针筒、关于男同性恋及恋童的书籍、对于盖西来说过于小的衣服、一把6mm口径的Brevettata起步枪和皮斯特工作的药店的收据。警方决定没收盖西的奥斯莫比（Oldsmobile）汽车和其他PDM公司的机动车，同时派出两组由两人组成的监视组去跟踪盖西。
第二天，调查者们接到了来自米高·罗西（Michael Rossi）的电话，得知格雷戈里·戈奇克（Gregory Godzik）和查尔斯·哈图拉（Charles Hattula）（另一位盖西的雇员）的尸体在前一年在一条伊利诺伊州的河流中被发现。
12月15日，德斯普兰斯对于盖西的前科案件有了更深入的调查，得知杰弗里·里格纳尔（Jeffrey Rignall）曾报案说盖西引诱其上了他的车并遭受他的虐待和强暴；在与盖西前妻对话中，警方得知了约翰·布特科维奇的失踪案。同时，在盖西家找到的戒指也被证明了是失踪男学生约翰·A·西茨（John A. Szyc）的戒指。同时调查者们也注意到了盖西的一名员工开着和西茨相似的汽车，调查证明了此车之前属于西茨。
12月17日，警方与米高·罗西进行了一次正式的会谈，得知盖西将西茨的汽车卖给他是因为后者称西茨需要钱搬到加利福尼亚州。同时，对盖西的奥斯莫比汽车调查中，警方发现了一小撮有可能是人类头发的纤维组织。这些纤维被送去进行检查。当晚，警方使用三条受训警犬调查皮斯特是否曾在盖西的汽车里出现过。其中的一条警犬躺在盖西的奥斯莫比汽车的乘客座上，向警方暗示皮斯特的尸体曾出现在这里。
12月20日，盖西开车去找他的律师萨姆·阿米兰特（Sam Amirante）。一到达目的地，他就要求对方给他一瓶酒。在回途中，阿米兰特问他和调查者谈得怎么样了，他指着一份《每日先驱报》（the Daily Herald），告诉他的律师“这个男孩已经死了，他在河里。”。
在最后的几个自由的小时里，盖西已经知道自己的逮捕是不可避免的了，他试图拜访自己的朋友并向他们告别。离开了律师办公室，他开车前往加油站，在那里给他的租车加了油，并递给加油工兰斯·雅各布森（Lance Jacobson）一小包大麻。雅各布森将大麻交给警方并告诉警方盖西对他说“我的末日即将来临，这些人会来杀我”。盖西然后驱车去了一位同行罗纳德·罗德（Ronald Rhode）家中。在那里，他拥抱了他的朋友，老泪纵横：“我杀了三十个人”。然后他开车去找米高·罗西和大卫·克拉姆。在他开车的时候，警方注意到他拿着一串玫瑰念珠，一边开车一边祈祷。
第二天，警方获得了第二次搜查令。考虑到盖西之前的反常行为，警方担心盖西会自杀，就以非法藏匿和分发大麻的罪名将其逮捕。